基因組測序是了解基因組的重要一步。基因組序列將代表一個有價值的捷徑，幫助科學家更加輕松快捷地找到基因。即使科學家只是在學習解釋這些線索，基因組序列的確包含一些有關基因位置的線索。
科學家們還希望，能夠研究整個基因組序列將有助于他們了解整個基因組的工作原理，即基因如何協(xié)同工作以指導整個生物體的生長，發(fā)育和維持。
最后，基因只占基因組DNA的不到25％，因此了解整個基因組序列將有助于科學家研究基因外的基因組部分。這包括控制區(qū)域的控制區(qū)域，這些區(qū)域控制基因的打開方式，以及長段的“廢話”或“垃圾” DNA（之所以這樣稱呼，是因為我們尚不知道該做什么，如果有的話）。
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